SKStoreReviewControllerとアプリ内メッセージはどちらが上に表示されますか？

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ここでは iOS 固有の事象について取り扱っております

SKStoreReviewControllerよりもアプリ内メッセージが上に表示されます。

なお、SKStoreReviewControllerの表示時に接客を表示したくない場合、suppress関数で接客表示の抑制が可能です。

// 接客の表示を抑制
InAppMessaging.shared.suppress() 

// レビューダイアログの表示をリクエスト
SKStoreReviewController.requestReview()

画面を離れるタイミングで unsuppress関数を呼び出して接客の表示抑制を解除してください。

InAppMessaging.shared.unsuppress()

suppress/unsuppressの詳細は以下ドキュメントを参考にしてください。
アプリ内メッセージの表示を抑制する